波士頓凯尔特人
2016年12月9日日托马斯迎來了自己的新紀錄。全場16投10中，包括7個三分球，及以100%的命中率罰進17個罰球，最後独得48分，帶領球隊在灰熊身上得到一場很不容易的勝場。
托马斯於2016年12月30日出場37分鐘，全場26投15中(三分13投9中)下攻入52分，不僅刷新自己在10天前才創下的生涯單場最高得分成績，更打破傳奇球星「大鳥」Larry Bird保有的隊史單節最高得分紀錄，帶領波士頓塞爾蒂克在主場以117比114力克邁阿密熱火。Thomas在第4節飆進6記三分球灌進29分，打破Bird在1983年創下的隊史單一球員單節最高得分紀錄。Thomas成為塞爾蒂克隊史第5位單場攻下50分的球員，在這9場至少50分的比賽中，他的52分名列隊史第4名。有趣的是，這也是NBA史上第16次有球員單場攻下至少50分而沒有傳出任何助攻的比賽。
2017年2月12日，湯瑪斯今天豪取29分及個人生涯單場新高15助攻，加上全隊飆進17記三分球，以115比104擊敗猶他爵士。
2017年2月15日，湯瑪斯今天砍下33分，連續40場得分超過20分，追平了塞爾蒂克的隊史記錄，以116比108擊敗費城76人。
2017年2月16日，湯瑪斯單場繳出全場最佳29分，成為隊史首位連續41場比賽得分超過20分的球員，可惜終場前0.9秒因爭議性判決．以103比104敗給芝加哥公牛中止4連勝。
2017年5月2日，湯瑪斯攻下季後賽生涯新高53分、比下沃爾（John Wall）的40分表現，這場的成績也讓他的名字寫入塞爾蒂克史冊，成為隊史第5人在季後賽單場飆破50分的球員，與1972年哈維契克（John Havlicek）保持隊史的最佳紀錄也只有1分之差。
2017年5月20日，塞爾蒂克隊官方稍早宣布一件壞消息，後衛Isaiah Thomas因為臀部髖關節的臼盂唇損傷，確定缺席剩餘季後賽賽事。
2017年6月12日,NBA賽季完結,以賽亞.湯瑪士獲得生涯新高,平均每場28.9分,5.9助攻